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長期使用醫用呼吸機后，內部易滋生微生物，會對患者造成嚴重危害。微生物于呼吸機內部繁衍，會污染氣體輸送系統，導致輸送給患者的氣體攜帶大量細菌、病毒等病原體。患者吸入被污染氣體，極可能引發呼吸道感染，特別是抵抗力低的患者，感染風險更高，甚至可能誘發嚴重肺部疾病。而且，微生物滋生還可能影響呼吸機正常運轉，導致設備故障，影響治療效果。
為防范和處理微生物滋生問題，需采取系列措施。應定期清潔與消毒呼吸機。依照設備制造商建議，對呼吸機各部件，像呼吸管道、濕化器、過濾器等進行拆卸、清洗及消毒。同時，保持呼吸機使用環境清潔，定期更換空氣過濾器，降低空氣中灰塵與微生物進入呼吸機的幾率。使用時，注意控制濕化器水位，防止水分過多滋生細菌。
若已出現微生物滋生狀況，需及時停用醫用呼吸機，并對其進行全面消毒。可運用化學消毒劑浸泡、高溫去菌等方式，確保殺滅微生物。
此外，要密切觀察患者，及時察覺并處理可能出現的感染癥狀。
